《南州六月荔枝丹》的全文说明顺序是 由主到次，由表及里。具体来说，文章分为两部分：

第一部分（第1段~10段）：

分三个层次说明荔枝的形态和果实。这部分详细描述了荔枝的外部形态（如外壳、颜色、果形、大小）和内部结构（如膜、肉、核、花）。

第二部分（第11段~14段）：

主要介绍荔枝生产的有关情况，包括荔枝的习性、产地、栽培史等。

这种说明顺序符合人们认识事物的一般规律，即先了解事物的整体特征，再逐步深入到细节。文章在重点介绍荔枝生态时，引用了白居易《荔枝图序》中的一句话作为说明的纲，进一步体现了由表及里的说明方法。