三毛在撒哈拉的故事中，最终与荷西结婚并共同生活在沙漠中。荷西在三毛离开后，申请到沙漠工作，并在六年后来到非洲与三毛团聚，向她求婚。三毛被荷西的痴情所打动，答应了他的求婚，但要求婚后保持自己的个性和作风。荷西深情地表示，如果失去了三毛的个性和作风，他就不必娶她。婚后，荷西陪伴三毛做了许多疯狂的事情，如驱车寻找化石、爬下崖底沙滩等，他们过上了自在而有趣的生活。

然而，这段美好的时光并没有持续太久。荷西在一次潜水事故中不幸丧生，这对三毛来说是巨大的打击。尽管如此，三毛在荷西去世后，仍然继续她的写作生涯，并出版了《撒哈拉的故事》等作品，记录了她与荷西在沙漠中的生活点滴和对这片土地的深情厚意。