李斯在《谏逐客书》中通过以下方式运用正反对比论证：

正面叙说与反面推论结合

文章以正面列举客卿对秦国的贡献为主，如秦国历史上的四位君王通过任用客卿成就霸业，同时简要反推逐客的潜在危害，形成“一正一反”的鲜明对比。

历史与现实对照

通过对比秦国先君纳客的辉煌成就（如“地广者粟多”）与当前逐客的短视行为，揭示逐客与包容人才的不同后果，强化论点的说服力。

具体事例与抽象道理结合

以“秦王所喜好的珍宝美色都出产于外国”为例，类比客卿对秦国发展的重要性，从反面揭露逐客的荒谬性，同时结合“藉寇兵而赍粮”的比喻，增强论证的层次感。

结构严谨与逻辑清晰

文章采用“一、三、五式”结构，层层递进，通过排比、对偶等修辞手法，使正反对比更加突出，最终实现“纳客逐客利害昭彰”的核心论点。

综上，李斯通过历史与现实的对照、具体事例的类比及结构化的论证布局，使正反对比论证既简洁有力又富有深度，成功说服秦王放弃逐客令。