当男朋友说“好困”时，你可以尝试以下几种幽默且富有情感的回复：

“早点休息，希望你梦里有我”。这句话不仅表达了你对他休息的关心，还带有一丝暧昧，暗示你希望他在梦中也能想起你。

“美好的时光总是这么的短暂”。这句话表达了对你们聊天时光的留恋，也能引发他对下一次聊天的期待。

“早点睡，熬夜了可就不帅了”。温柔又体贴，既关心他的健康，又带有一丝幽默，适合用来结束一天的聊天。

“我也有点困了”。这种回复方式显得真诚且善解人意，但要注意不要让对方觉得你是在纠缠他。

“晚安，梦里有您”。这句话带有浪漫和暧昧的成分，适合在较为亲密的关系中使用。

“明早我想和你一起醒来”。这句话诗意且浪漫，适合希望与对方有共同经历的人。

“一个人睡觉好害怕，害怕感随着时间的推移在不断加深”。这种回复方式带有一些撒娇和示弱的成分，适合想要更多关心和陪伴的人。

“哈哈，你这么能睡啊，是不是最近又熬夜了？”。这种幽默的回复可以缓解困倦的气氛，但要注意不要让对方觉得你在调侃他。

“好吧，那你先休息吧，我们明天再聊”。这种回复方式既体贴又尊重对方，适合在关系较为随意的情况下使用。

“晚安，记得盖好被子，别着凉了”。这种回复方式既关心对方的健康，又带有一丝温柔，适合在较为亲密的关系中使用。

选择哪种回复方式取决于你与男朋友的关系以及你想要传达的情感。无论选择哪种方式，关键是要真诚且体贴，让对方感受到你的关心和理解。