全国艺术特长生证书在一定程度上是全国承认的。这些证书是由教育部直属的几所大型艺术院校颁发的，如中央音乐学院、中国艺术研究院国家芭蕾舞团艺术学校、中国戏曲学院、上海戏剧学院、中国美术学院等，因此具有国家认可的特长证书的性质。

然而，需要注意的是，尽管这些证书是全国性的，但在实际使用时，不同单位或机构对这种特长证书的需求和认可程度可能会有所不同。教育部明确表示，从未成立全国艺术特长生认证中心，也从未认可过任何艺术特长生认证机构，并不鼓励学生参与社会机构等相关组织开展的艺术特长生测评与认证活动。

此外，有信息称全国社会艺术水平考试教育局并不认可这种打着全国旗号的社会艺术水平考试证书，因此不建议将其作为特长生的证书来使用。

综上所述，全国艺术特长生证书虽然具有一定的全国认可度，但具体认可程度可能因单位或机构的不同而有所差异。建议在使用这些证书时，先了解相关单位和机构的要求和认可情况，以确保其有效性。