体育本科线比艺术类本科差的原因主要有以下几点：

训练时间长：

体育生需要花费大量时间进行体能训练，这导致他们用于学习文化课的时间相对较少。长时间的体能训练可能会影响他们的学习效率和成绩。

缺课较多：

由于训练和比赛的需要，体育生可能会经常缺课，这进一步减少了他们接触和学习文化课的机会。

专业要求高：

体育生的专业要求通常较高，他们需要在专业上投入大量时间和精力，这可能导致他们在文化课上无法达到与其他学生相同的水平。

文化课基础薄弱：

由于上述原因，体育生的文化课基础可能相对薄弱，这也影响了他们在高考中的表现。

平衡专业与文化：

为了平衡专业与文化的录取标准，保证艺术体育人才选拔的公平性，有时会对体育生的文化课要求相对较低。

综上所述，体育本科线比艺术类本科差的原因是多方面的，包括训练时间长、缺课多、专业要求高、文化课基础薄弱以及为了平衡专业与文化的要求等。这些因素共同作用，导致体育生在高考中的文化课成绩普遍较低，从而影响了他们的录取线。